В коллекцию «Зоология и ботаника» входят собрания таксидермических экспонатов и беспозвоночных животных (насекомых, пауков, моллюсков и др.). А также гербарий из 42 видов представителей таежной растительности, сформированной в результате почвенно-геоботанических исследований бассейна р. Кыртыпьях.

Украшением музея является коллекция тропических насекомых, среди которых бабочки морфиды считаются самыми красивыми. К необычным бабочкам относятся представители семейства уранид. Самые красочные бабочки относятся к семейству нимфалид.

Коллекция раковины моллюсков включает представителей двух классов: двустворчатые и брюхоногие. К двустворчатым относятся моллюски: мидии, устрицы, гребешки, сердцевики. К брюхоногим - из морских форм в коллекции музея представлены конусы, мурексы, ципреи, рапаны, галиотисы и др.

В коллекцию таксидермических экспонатов входят чучела птиц и зверей обитающих в Западной Сибири. Большая часть этой коллекции выполнена известным художником и таксидермистом, краеведом города Мегион Шлябиным Дмитрием Дмитриевичем.